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浮游菌采样器作为一种高效的多孔吸入式采样器，基于安德森撞击原理，将空气中的微生物撞击并“捕获”到琼脂培养基上进行培养计数。
它广泛应用于制药工业、食品工业、饮料及自来水、药检所、卫生防疫、医院和公共场所等有关行业和部门。
现在比较常见的采样流量有28.3L/min、50L/min、100L/min、136L/min等，采样头和采样泵是浮游菌采样器最核心的部件，不同类型的浮游菌采样器其采样头和采样泵的集成方式是不一样的，有一些采用的分体式采样头，有些采样头和采样泵是集成在一个机子上的，如果想要提高采样效率和采样代表性，一般采用大流量的采样器，来达到最短时间采集最多的空气样本。
目前浮游菌的采样流量大多是100L/min，不管采样头和采样泵是以哪种方式集成的，我们依旧不能简单的以采样流量来对浮游菌采样器进行分类，而应该从仪器构造和负载能力来区分。采样头的主要指标是狭缝或微孔的尺寸、数量。
对浮游菌采样器的校准过程存在两种方法，分别为对目标采样时间和目标采样流量的调节；从而满足目标总采样体积的要求。
方法1：将实测流量值输入采样器，即实际流量值修正。通过调整采样时间，即使实测流量比预设流量差很多，仍然保障采样总体积的准确性。
方法2：通过调节风机功率来调节并达到目标:采样流量，即目标流量值调节。该方法根据调节步骤又分为硬件调节和软件调节。
对于普通的大气采样器，方法1是合适的，因为它强调累积采样体积的准确性。但对于浮游菌采样器，不仅采样体积是重要的，采样流量也是重要的，因为它是利用安德森撞击原理，将空气中浮游菌撞击采集到琼脂上进行培养计数的。
由于这种收集跟微粒的大小和撞击速度有关，而和采样时间无关。因此，如果采样流量发生大的偏差(一般偏小)，即使方法1得到的最终采样体积是准确的，但由于撞击速度不够，只有大微粒被捕集，而小微粒被漏掉，测量结果不准确，可能会造成大的损失。
一般来说，负载能力强的采样器，可直接与传统气体采样器流量校验装置连接和检测。低负载浮游菌采样器，只能利用基于叶轮风速计或罗茨流量计原理的校准装置进行检测，两种装置各有利弊。
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